المقارنة بين طرائق تحليل انحدار الـــ QTL باستخدام المحاكاة
Abstract
في هذا البحث تَمّ دراسة النموذج الجيني الذي يتناول خواصاً جينية أو سمات (Markers) لمناطق محددة من الكروموسومات التي تكون خواصها طبيعية تتأثر بالبيئة لذلك فإن استعمال نماذج الانحدار الخطي المتعدد تكون مناسبة لقياس هذا التأثير ولذلك تم استخدام طرائق منها انحدار هيلي نوت Knott regression Haley- و انحدار هيلي نوت الموسع Knott regression Haley- Extended و انحدار الواسمات Regression Marker واستخدام خوارزمية الانحدار أو خوارزمية ( (EM EM Regression OR EM algorithm ولغرض التطبيق تم محاكاة مجتمع (F2 intercross) بالاعتماد على نموذج مواقع الصفات الكمية التجميعي (additive QTL model) باستعمال الدالة (sim.cross) ضمن بيئة البرنامج R .
ولغرض المقارنة بين أداء طرائق تحليل مواقع الصفات الكمية(QTL) تم محاكاة مجتمع التضارب العكسي (backcross) بالاعتماد على نموذج مواقع الصفات الكمية التجميعي (additive QTL model) بوجود سلالتين فطريتين هما (A) و ((B باستعمال الدالة (sim.cross) ضمن بيئة البرنامج R وتطبيق هذه الطرائق .
Deprecated: Return type of Carbon\Traits\Date::createFromTimestamp($timestamp, $tz = null) should either be compatible with DateTime::createFromTimestamp(int|float $timestamp): static, or the #[\ReturnTypeWillChange] attribute should be used to temporarily suppress the notice in /home/iqserver/journals/kjeas.uowasit.edu.iq/lib/pkp/lib/vendor/nesbot/carbon/src/Carbon/Traits/Timestamp.php on line 29
Downloads
References
East. E.M. 1908. In breading in corn. P. 414-212.
Haley, C.S. and S.A. Knott. 1992. A simple regression method for mapping quantitative trait loci in line crosses using flanking markers. Heredity 69:315-324.
Hill, W. G. 1990. Considerations in the design of animal breeding experiments. In D. Gianola and K. Hami mond (eds.), Advances in statistical methods for genetic improvement of livestock, pp. 59-76. Springer-Verlag , Berlin (17) .
Hill, W.G.1970. Design of experiments to estimate heritability by regression of offspring on selected parents. Biometrics 26: 566-571 [17] .
Julius Van der Werf,2000, Chapter 9 , "method for QTL analysis" .
Kao, 2000,''On the differences between maximum likelihood and regression interval mapping in the analysis of quantitative trait loci''. Genetics 156, 855–865.
Mskay & Falconer ,1996, ''Introduction tO Quantitative Genetics'' ,fourth edition , Addison Wesley Longman , Harlow ,Essex, UK .
Whittaker , J.C. , Thompson ,R ., & Visscher , 1996, ''On the mapping of QTL by regression of phenotype on marker Type ''.Heredity 77:23-32 .
Wright, Sewall (1951). "The genetical structure of populations". Annals of Eugenics. 15: 323–354.
